米国疾病予防管理センター（CDC）は、SARS-CoV-2シーケンスデータのパブリックドメインへのリリースをスピードアップするシーケンスラボの全国ネットワークを開始するためのコンソーシアムを立ち上げました。 オープンコロナウイルス配列データの迅速なリリースは、ガイドに役立ちます コロナ 公衆衛生への対応、イノベーションと発見の推進、そして現在と将来のパンデミックについての理解を深めます。
この SARS-CoV-2シーケンスによる公衆衛生の緊急対応、疫学、監視（SPHERES） コンソーシアムは、の使用を大幅に拡大します 全ゲノム配列決定（WGS） COVID-19ウイルスの。 SPHERESは、全国のCOVID-19の症例とクラスターを調査する公衆衛生対応チームに、一貫性のあるリアルタイムのシーケンスデータを提供します。
この新しいコンソーシアムは、ウイルスが全国的にも地域社会でもどのように広がっているかをよりよく理解するのに役立ちます。 より良いデータは、次に、公衆衛生当局が感染の連鎖を中断し、新しい病気の症例を防ぎ、命を守り、救うのに役立ちます。
「米国は、高度な高速ゲノムシーケンスの世界的リーダーです。 私たちの公的、私的、臨床的、および学術的な公衆衛生研究所全体にわたるこの協調的な取り組みは、SARS-CoV-2の伝播、進化、および治療を理解する上で重要な役割を果たします。 私たちの最高の、最も熟練した心が協力して、今日と明日の命を救うのを助けていると確信しています」とCDCディレクターのロバートレッドフィールド医学博士は述べています。
進化するCOVID-19ウイルスの追跡
ゲノム配列データは、COVID-2を引き起こすウイルスであるSARS-CoV-19の生物学に前例のない洞察を与え、パンデミックの変化する風景を定義するのに役立ちます。 CDCおよびその他の公衆衛生当局は、米国全土からウイルスをシーケンスすることにより、ウイルスの重要な変化を監視し、この情報を使用して、コンタクトトレーシング、公衆衛生緩和の取り組み、および感染管理戦略をガイドできます。
SPHERESコンソーシアムは、SARS-CoV-2ゲノム配列決定を全国的に調整する野心的な取り組みであり、数十の小規模な個別の取り組みを、研究所、機関、企業の単一の分散ネットワークに編成しています。 このコンソーシアムは、40の州および地方の公衆衛生部門、いくつかの大規模な臨床検査機関、および連邦政府、学界、および民間部門全体のXNUMXを超える協力機関の専門知識、技術、およびリソースを組み合わせたものです。
SPHERESは、ベストプラクティスとコンセンサスデータ標準を確立し、オープンデータ共有を加速し、リソースと専門知識のプールを確立して、最先端のテクノロジーを国のCOVID-19対応にもたらすのに役立ちます。
SPHERESデータを開き、共有
コンソーシアムのメンバーは、迅速なオープンシーケンス共有への取り組みを共有しています。 彼らは、すべての有用な配列データを、国立医学図書館の国立バイオテクノロジー情報センター（NLM / NCBI）、鳥インフルエンザ情報共有の世界的イニシアチブ（GISAID）、およびその他の公的配列リポジトリに提出する予定です。 これにより、米国全土からのウイルス配列データが公衆衛生上の意思決定に迅速に利用可能になり、世界中の研究者が自由にアクセスできるようになります。
コンソーシアムのメンバーは次のとおりです。
連邦政府機関および研究所
疾病管理予防センター、高度な分子検出のオフィス
アルゴンヌ国立研究所
防衛保健庁、 グローバル感染性 病気 監視
食品医薬品局
ローレンス・バークレー国立研究所
Los Alamos National Laboratory
国立アレルギー感染症研究所、ゲノミクスおよび先端技術局
米国標準技術局
国立医学図書館の国立バイオテクノロジー情報センター
ウォルターリード陸軍研究所
州/地方の公衆衛生研究所
アリゾナ州
カリフォルニア
デラウェア
コロンビア特別区
フロリダ州
ハワイ
メイン
メリーランド
マサチューセッツ州
ミシガン州
ミネソタ州
ノースカロライナ州
ノースダコタ州
ネバダ
ニューメキシコ州
ニューヨーク
ユタ州
バージニア州
ワシントン
ウィスコンシン州
ワイオミング州
学術機関
ベイラー大学
コーネル大学
フレッドハッチンソンがん研究センター
シナイ山医学部
ニューヨーク大学
北アリゾナ大学
バッファロー大学
カリフォルニア大学バークレー校
カリフォルニア大学デービス校
カリフォルニア大学アーバイン校
カリフォルニア大学ロサンゼルス校
カリフォルニア大学、サンフランシスコ
カリフォルニア大学サンタクルーズ校
シカゴ大学
メリーランド大学
ミネソタ大学
ネブラスカ大学
ニューメキシコ大学
ワシントン大学
イェール大学
法人
アボット診断
ビオメリュー
カラーゲノミクス
銀杏バイオワークス
IDbyDNA
インキュー電話
LabCorp
XNUMXつのコーデックス
オックスフォードナノポアテクノロジーズ
太平洋バイオサイエンス
キアゲン
クエスト診断
本当にライフサイエンス
企業の名前は情報提供のみを目的として提供されており、ここに含まれていても、米国疾病予防管理センターによる企業またはその商用製品またはサービスの推奨を構成するものではありません。
非営利の公衆衛生または研究機関
公衆衛生研究所協会
ビル＆メリンダ·ゲイツ財団
ブロード研究所
チャンザッカーバーグBioHub
クレイグベンターインスティテュート
ゲノム疫学のための公衆衛生同盟
スクリップスリサーチ
ジャクソンラボラトリー
トランスレーショナルゲノミクス研究所–北
ウォルダー財団
過去2年間、CDCの高度分子検出局プログラムは、感染症の監視と発生対応のための病原体ゲノミクスやその他の高度な実験技術の使用を拡大するために、連邦および州の公衆衛生研究所に投資してきました。 現在のコンソーシアムへの投資は、SARS-CoV-XNUMXパンデミックの命を救い、将来のパンデミック対応に備えて米国と世界を準備することを目的としています。
高度な分子検出におけるゲノム配列決定またはCDCの取り組みの詳細については、次のWebサイトをご覧ください。 https://www.cdc.gov/amd/
